廣州中醫(yī)藥大學第三附屬醫(yī)院是一所建設(shè)目標為具有專科特色，集醫(yī)療、教學、科研為一體的現(xiàn)代化、綜合性中西醫(yī)結(jié)合醫(yī)院。三院始建于2001年，目前擁有廣州中醫(yī)藥大學附屬骨傷科醫(yī)院和芳村區(qū)中醫(yī)院兩所分院。2005年成立廣州中醫(yī)藥大學第三臨床醫(yī)學院，同年招收中醫(yī)學（骨傷科方向）本科生，第三附屬醫(yī)院和第三臨床醫(yī)學院實行院系合一的管理體制，是廣州中醫(yī)藥大學重要的醫(yī)療、教學、科研基地。

廣州中醫(yī)藥大學第三附屬醫(yī)院設(shè)有廣州中醫(yī)藥研究院骨傷科研究所、廣東省中醫(yī)骨質(zhì)疏松病專病治療中心、國家藥物臨床試驗研究(GCP中心）、廣州中醫(yī)藥大學骨質(zhì)疏松中心、廣州中醫(yī)藥大學股骨頭壞死防治中心等，是廣州中醫(yī)藥大學國家級重點學科和省級重點學科“中醫(yī)骨傷科學”的重要組成部分，是廣州中醫(yī)藥大學博士后流動站和博士、碩士研究生培養(yǎng)基地之一，現(xiàn)承擔多項國家及省市級科研課題。

廣州中醫(yī)藥大學第三附屬醫(yī)院現(xiàn)有職工400多人，政府授予的名中醫(yī)1人，高級職稱醫(yī)務人員24人。博士生導師3人，碩士生導師9人。醫(yī)院獲獎科研成果3項，申請專利2項，自主開發(fā)研制院內(nèi)制劑20余項，其中1項（中藥新藥6類）已獲國家食品藥品監(jiān)督管理局臨床研究批文，并成功轉(zhuǎn)讓。近五年來承擔有國家級課題2項、省部級課題15項、廳局級課題40項、校級課題10項。

廣州中醫(yī)藥大學第三附屬醫(yī)院還同海外著名醫(yī)療及科研中心――澳大利亞西澳大學開展廣泛合作與交流。醫(yī)院配備有各種先進醫(yī)療儀器設(shè)備，總值超過4000萬元，主要由螺旋CT、雙能X線骨密度儀（DEXA）、大型X光機、彩色多普勒B超機、酶標儀、全自動生化分析儀、PCR、動態(tài)心電圖、心電監(jiān)護儀等。中心實驗室擁有的先進儀器能開展細胞學、組織免疫、組織化學、分子生物學、基因水平等檢測。

廣州中醫(yī)藥大學第三附屬醫(yī)院目前正加緊進行第三附屬醫(yī)院總院建設(shè)，總院地處荔灣區(qū)（原芳村區(qū)）龍溪大道，占地93畝，主體建筑面積近10萬平方米，設(shè)計總床位800張，按具有專照三級甲等中醫(yī)院標準將總院建設(shè)科特色、現(xiàn)代化的綜合性中西醫(yī)結(jié)合醫(yī)院。