番禺第二人民醫院前身為大崗人民醫院，始建于1958年，1995年被評定為國家二級甲等醫院，2008年5月更名為番禺區第二人民醫院，目前已經發展成為一所集醫療、教學、科研、預防保健、康復和健康宣教為一體的現代化綜合性醫院。

番禺第二人民醫院近年來堅持微創技術為顯著特色的理念來辦院，倡導微創化治療的人性化服務，讓患者在微小的創口甚至無創的治療下就能換來身體的健康，大大減輕了病痛所帶來的傷害。
2004年番禺第二人民醫院腹腔鏡-內鏡外科被列為番禺區重點在建學科后，以腹腔鏡技術為龍頭的微創技術系列專科、無痛技術系列服務逐漸成為醫院的顯著特色，并先后開展了腹腔鏡、膽道鏡、宮腔鏡、輸尿管鏡、膀胱鏡、前列腺電切鏡、鼻內窺鏡、電子胃腸鏡以及介入等一系列微創手術，微創技術在各個學科得到拓展和應用，微創觀念深入人心。其中，由著名腹腔鏡專家喬鐵副主任醫師主持的腹腔鏡微創技術在區內、廣州市均處于先進水平，指導和協助省內20余家醫院開展該項技術，每年吸引百余名來自香港、珠三角等地的患者慕名前來就醫，逐漸形成強有力的品牌效應和良好的社會效應。

番禺第二人民醫院2006年9月在北京大學第一附屬醫院張寶善教授的指導下開始開展內鏡微創保膽取石術，這在廣州地區開了做保膽取石、取息肉手術的先例，與全國大部分地區還在開展切膽手術相比，保膽的理念受到眾多患者的支持，全國各地的患者聞訊前來做保膽手術，廣州各大媒體也紛紛對此進行了報道。目前已經完成微創保膽手術400多例，隨著保膽手術的深入開展，番禺第二人民醫院院長、保膽取石手術專家喬鐵帶領醫院的保膽取石技術骨干又完成個多項技術攻關，改變單純使用纖維膽道鏡取石的方法，用迷爾腹腔鏡抓取膽囊，纖維膽道鏡聯合新型硬性膽道鏡取石，用推、壓、擠、撕、撐、沖六種獨創取石手法，將膽囊結石、膽囊息肉取得干干凈凈；在國內率先發現并取出隱藏在膽囊壁間的結石，創新四項核心技術。目前該項技術已經達到國內先進水平，保住膽囊不切膽的理念也被越來越多的人所接受,為醫院創造了巨大的社會效益。

番禺第二人民醫院2007年12月7日—9日成功承辦了由中國醫師協會內鏡醫師分會主辦的“全國首屆內鏡微創保膽取石學術大會”，奠定了番禺第二人民醫院保膽取石技術在全國的學術地位，將醫院的發展帶到了一個嶄新的階段。

番禺第二人民醫院作為非營利性醫療機構，番禺第二人民醫院始終將群眾的利益擺在首位，2006年9月開始，醫院啟動白內障復明工程，與中山大學眼科醫院合作開展白內障復明手術，在大崗鎮政府及區衛生局的大力支持下，為大崗鎮及南番禺地區參加農保和醫保的白內障患者免費實施復明手術。到目前為止，已經有近千名白內障患者在大崗醫院獲得了光明，開始了新的生活。隨著白內障復明工程的深入開展，還將有更多的白內障患者受益于此。伴隨番禺第二人民醫院五年（2006-2010）發展規劃與遠景目標的出臺，番禺第二人民醫院的發展目標更加明確，在五年內建設成為南番禺地區醫療中心，以及微創特色突出的區域性品牌醫院，初步形成功能完善、滿足需求的一體化管理的衛生服務網絡，為沙田區人民群眾提供優質、高效、安全、便捷和經濟的醫療服務。