上海交通大學醫(yī)學院附屬上海兒童醫(yī)學中心（簡稱“兒中心”）是由上海市人民政府與世界健康基金會（ProjectHOPE）合作共建的一所集醫(yī)、教、研于一體的三級甲等兒童專科醫(yī)院。1998年6月1日醫(yī)院正式開張，前國家主席江澤民同志為醫(yī)院題寫院名，美國前總統(tǒng)夫人希拉里·克林頓女士為醫(yī)院開張剪彩，2011年，美國新任駐華大使駱家輝先生到訪醫(yī)院，將兒中心譽為“中美醫(yī)學成功合作典范”。
　　醫(yī)院占地面積100畝，總建筑面積約8.4萬平方米，規(guī)模床位1000張，實際開放床位604張，重癥監(jiān)護床位數(shù)配置占總數(shù)的1/5。目前，年門急診總量約140萬人次，出院病人約2.2萬人次，手術病人約1.3萬人次，門急診、日間手術0.7萬人次。2010年，兒中心成為國內(nèi)首家通過JCI國際醫(yī)院認證的兒童專科醫(yī)院。2012年，醫(yī)院獲得國家藥物臨床試驗機構(gòu)資格認定證書，共8個專業(yè)獲得藥物臨床試驗專業(yè)資格。此外，醫(yī)院擁有多個在國內(nèi)外具有重要影響力的優(yōu)勢特色學科。心臟中心是國內(nèi)建立最早、全球規(guī)模最大的小兒先心病診治中心。心臟手術量每年逾3500例，其中復雜、疑難先心病大于55%;，手術成功率在97%;以上，手術最小年齡為生后6小時，最輕體重800g；心導管術1400余例。在國內(nèi)率先開展大血管調(diào)轉(zhuǎn)術、先心病合并氣道狹窄根治術、雙調(diào)轉(zhuǎn)手術、兒童永久起搏器植入術以及胎兒心血管超聲、核磁共振檢查等多項新技術并在全國推廣。兒童血液腫瘤中心已成為國內(nèi)規(guī)模最大的診治中心，每年收治新發(fā)白血病及腫瘤病例450余例，累計完成各類疑難重癥的造血干細胞移植近500例，兒童急性淋巴細胞性白血病5年無病生存率大于75%;，再生障礙性貧血移植總體成功率為91%;，達到發(fā)達國家先進水平。兒童保健（發(fā)育行為兒科）專業(yè)是我國該學科領域的發(fā)源地之一，近年來學科在注意缺陷多動癥、孤獨癥等發(fā)育行為兒科疾病率先進行了醫(yī)教結(jié)合干預模式，同時團隊在鉛中毒、新生兒聽力篩查和兒童睡眠健康項目中有效實現(xiàn)了科學研究向公共衛(wèi)生政策的轉(zhuǎn)化，獲得了三項國家科技進步二等獎，同時得到了國際同行的高度認可。
　　醫(yī)院作為上海交通大學醫(yī)學院的附屬醫(yī)院，兒科學專業(yè)已經(jīng)成為國家重點學科、211工程、985工程、085工程重點建設學科，相關兒科亞專業(yè)相繼獲得國家臨床重點專科、衛(wèi)生部重點實驗室、衛(wèi)生部首批小兒先天性心臟病診斷和介入治療繼續(xù)教學的培訓基地、上海市首批臨床醫(yī)學中心、上海市醫(yī)學重點學科及上海市公共衛(wèi)生重點學科等。醫(yī)院還設有國內(nèi)首家兒科轉(zhuǎn)化醫(yī)學研究所、上海市小兒先心病研究所，以及兒童聽力、兒童血液腫瘤、注意力缺陷、呼吸循環(huán)、小兒肝病、兒童癲癇、兒童睡眠障礙等多個研究所及臨床診治中心。15年來，先后獲得國家科技進步二等獎5項（合作2項），多次獲得上海市科技進步一等獎、中華醫(yī)學會科技進步獎、教育部科技進步獎、宋慶齡兒科醫(yī)學獎等重大科研獎勵。近年來，醫(yī)院引進并培養(yǎng)了一批學科骨干，獲得中央千人計劃、上海市千人計劃、國家優(yōu)青、東方學者、衛(wèi)生系統(tǒng)領軍人才等各類人才資助計劃。醫(yī)院設有兒科專業(yè)博士后流動站、博士、碩士培養(yǎng)點，也是上海市兒科住院醫(yī)師規(guī)范化培訓的主要基地之一。
　　醫(yī)院先后與30余個國家和地區(qū)的醫(yī)療機構(gòu)，包括與23個世界最具影響力的兒童醫(yī)院建立了友好合作關系。此外，醫(yī)院秉著“培訓—培訓者”的理念，連續(xù)十年開展“西部及東北地區(qū)兒科醫(yī)護人員培訓項目”，免費為西部及東北部邊遠地區(qū)18個省、53個城市培養(yǎng)了273名兒科人才。醫(yī)院在國內(nèi)率先設立醫(yī)務社會工作部，建院以來共有近萬名患者獲得資助和治療。