護國寺中醫院始建于1952年。是北京市成立最早的公立中醫醫療機構之一。從六十年代起，就作為北京中醫學院(現北京中醫藥大學)的教學，實習醫院，1994年正式成為北京中醫藥大學附屬醫院。1995年被評為國家二級甲等中醫醫院，1996年被評為全國示范中醫醫院。1997年又被評為首都精神文明先進單位和西城區文明示范窗口單位。同時還作為中國中醫研究院針灸研究所外國留學生的臨床實習醫院，每天接待大雖國內外學習、參觀、就診人員。
護國寺中醫院以中醫中藥為主體，是全面承擔著醫療、教學、科研、預防、社區保健和康復任務的綜合性中醫醫院，在國內、外享有較商聲譽。現有職工500多人，其中高級職稱專業技術人員50余人，技術力量雄厚。醫院開設有內、外、針、骨科病床300張。門診設中醫內、外，針、骨、婦、兒，皮、眼、五官、口腔、急診、腸道及放射、檢驗、心電、超聲、心腦功能檢查、胃鏡、理療、手術室、中西藥房、中西藥制劑等科室30余個。有普通門診、專家門診、外賓門診為患者提供優質服務。每日門診量近千人次，全年無休日開診。