廈門市中醫院創建于1956年11月，是全國首批示范性中醫院、三級甲等中醫院，首任院長為全國著名老中醫、愛國僑領陳應龍。歷經半個世紀的發展，現為福建中醫藥大學附屬醫院、北京中醫藥大學廈門臨床醫學院、福建中醫藥大學臨床醫學院。醫院在東南亞享有盛譽，是福建省對外中醫交流的重要窗口。
　　廈門市中醫院現有職工1267名，其中主任、副主任醫師180多名，享受國務院特殊津貼專家4名，碩士生導師16名，全國名老中醫4名。開放床位900張（其中新院址設600張床位，原江頭分院作為肝病、肛腸病治療中心，設300張床位）。醫院占地面積7.25萬m2,建筑面積9.6萬m2，年門診量超過160余萬人次，年出院病人超過2.5萬人次，是目前福建省規模最大的綜合性中醫院。
　　廈門市中醫院臨床科室齊全，綜合功能完善，中醫特色鮮明。設有急診科、內科、外科、中醫外科、婦科、產科、兒科、針灸科、腫瘤科、骨科、骨傷科、肝炎科、傳染病科、肛腸科、五官科、推拿康復科、美容科、檢驗科、放射科、物診科、病理科、中心實驗室等一級臨床、醫技科室，專科專病門診數達67個。擁有全國重點專科專病：肝病中心和“慢性胃炎”專病；全國重點專科創建單位：肛腸科、中醫兒科；福建省重點中醫專科：肝病中心、肛腸科與糖尿病專科；福建省重點專病：慢性胃炎；福建省重點中醫專科創建單位：中西醫結合小兒科、中西醫結合骨科、中西醫膽胰專科。醫院醫療設施先進，配置了8層螺旋CT、核磁共振、DR、西門子800MAＸ光機、貝克曼自動生化分析儀、東芝無暗盒遙控X線機、電子腹腔鏡等價值1.5億元的大型精密設備，擁有兩個達到部頒二級標準的PCR實驗室。近年來，醫院加大培養和引進中西醫高級人才的力度，組成了高素質的人才團隊。
　　八十年代以來，隨著廈門作為經濟特區對外開放，先后有來自亞洲、歐美20余個國家和港澳臺地區的外籍學者及華僑來醫院進修學習。特別是1986年廈門市中醫院籌建廈門國際中醫培訓交流中心之后，對外交流更加頻繁，為弘揚祖國醫學作出了積極貢獻。2004年2月，經福建省衛生廳批準，醫院正式加掛“廈門華僑醫院”牌子，全國僑聯主席林兆樞先生親自為廈門華僑醫院揭牌。2006年5月,醫院成立“港澳臺僑胞診療中心”，為海內外僑胞提供祖國傳統醫療服務。2008年，廈門市中醫院成為國家中醫藥管理局中醫藥國際合作基地。2008年7月，在廈門市中醫院成立了“廈門海峽中醫藥合作發展中心”，成為國家中醫藥管理局設在廈門的唯一開展兩岸中醫藥交流的基地。
　　廈門市中醫院今后將繼續保持中醫藥在預防、保健方面的領先地位，同時融合現代醫學精華，致力于民眾的醫療救治、健康保障工作。做到急診強、診斷明、特色足，療效好，成為國內一流、省內領先的三級甲等綜合性中醫院。