廈門市中醫(yī)院創(chuàng)建于1956年11月，是全國首批示范性中醫(yī)院、三級甲等中醫(yī)院，首任院長為全國著名老中醫(yī)、愛國僑領陳應龍。歷經(jīng)半個世紀的發(fā)展，現(xiàn)為福建中醫(yī)藥大學附屬醫(yī)院、北京中醫(yī)藥大學廈門臨床醫(yī)學院、福建中醫(yī)藥大學臨床醫(yī)學院。醫(yī)院在東南亞享有盛譽，是福建省對外中醫(yī)交流的重要窗口。
　　廈門市中醫(yī)院現(xiàn)有職工1267名，其中主任、副主任醫(yī)師180多名，享受國務院特殊津貼專家4名，碩士生導師16名，全國名老中醫(yī)4名。開放床位900張（其中新院址設600張床位，原江頭分院作為肝病、肛腸病治療中心，設300張床位）。醫(yī)院占地面積7.25萬m2,建筑面積9.6萬m2，年門診量超過160余萬人次，年出院病人超過2.5萬人次，是目前福建省規(guī)模最大的綜合性中醫(yī)院。
　　廈門市中醫(yī)院臨床科室齊全，綜合功能完善，中醫(yī)特色鮮明。設有急診科、內科、外科、中醫(yī)外科、婦科、產(chǎn)科、兒科、針灸科、腫瘤科、骨科、骨傷科、肝炎科、傳染病科、肛腸科、五官科、推拿康復科、美容科、檢驗科、放射科、物診科、病理科、中心實驗室等一級臨床、醫(yī)技科室，專科專病門診數(shù)達67個。擁有全國重點專科專病：肝病中心和“慢性胃炎”專病；全國重點專科創(chuàng)建單位：肛腸科、中醫(yī)兒科；福建省重點中醫(yī)專科：肝病中心、肛腸科與糖尿病專科；福建省重點專病：慢性胃炎；福建省重點中醫(yī)專科創(chuàng)建單位：中西醫(yī)結合小兒科、中西醫(yī)結合骨科、中西醫(yī)膽胰專科。醫(yī)院醫(yī)療設施先進，配置了8層螺旋CT、核磁共振、DR、西門子800MAＸ光機、貝克曼自動生化分析儀、東芝無暗盒遙控X線機、電子腹腔鏡等價值1.5億元的大型精密設備，擁有兩個達到部頒二級標準的PCR實驗室。近年來，醫(yī)院加大培養(yǎng)和引進中西醫(yī)高級人才的力度，組成了高素質的人才團隊。
　　八十年代以來，隨著廈門作為經(jīng)濟特區(qū)對外開放，先后有來自亞洲、歐美20余個國家和港澳臺地區(qū)的外籍學者及華僑來醫(yī)院進修學習。特別是1986年廈門市中醫(yī)院籌建廈門國際中醫(yī)培訓交流中心之后，對外交流更加頻繁，為弘揚祖國醫(yī)學作出了積極貢獻。2004年2月，經(jīng)福建省衛(wèi)生廳批準，醫(yī)院正式加掛“廈門華僑醫(yī)院”牌子，全國僑聯(lián)主席林兆樞先生親自為廈門華僑醫(yī)院揭牌。2006年5月,醫(yī)院成立“港澳臺僑胞診療中心”，為海內外僑胞提供祖國傳統(tǒng)醫(yī)療服務。2008年，廈門市中醫(yī)院成為國家中醫(yī)藥管理局中醫(yī)藥國際合作基地。2008年7月，在廈門市中醫(yī)院成立了“廈門海峽中醫(yī)藥合作發(fā)展中心”，成為國家中醫(yī)藥管理局設在廈門的唯一開展兩岸中醫(yī)藥交流的基地。
　　廈門市中醫(yī)院今后將繼續(xù)保持中醫(yī)藥在預防、保健方面的領先地位，同時融合現(xiàn)代醫(yī)學精華，致力于民眾的醫(yī)療救治、健康保障工作。做到急診強、診斷明、特色足，療效好，成為國內一流、省內領先的三級甲等綜合性中醫(yī)院。