2013年5月9日，昆明三博腦科醫院正式通過昆明市衛生局及相關單位組織的三級專科醫院等級評審，這些步驟的完成標志著昆明三博腦科醫院與西山區人民醫院的合作正式開始，作為首都醫科大學附屬醫院北京三博腦科醫院的連鎖機構，昆明三博落戶云南!

　　昆明三博腦科醫院建筑面積10762平方米，可以設置床位150張，醫院為營利性股份制醫院，實行董事會領導下的院長負責制，按照現代化企業制度和醫院設置標準組建管理團隊，復制背景三博腦科醫院的管理模式和理念。以北京三博腦科醫院專家、教授組成醫院的核心技術團隊，同時實行醫療人才外聘制。按照150張床位的1:1.7標準配備人員，基本編制195人，其中，衛生技術人員137人，占70%，醫技68人，護士69人;行政后勤人員58人，占30%。

　　病區設置為：神經外科一病區，主要是癲癇及功能神經外科疾病;神外二病區，顱底腫瘤外科與小兒神經外科疾病診療;神外三病區，神經血管與脊柱脊髓疾病診療;神經內科病區是癲癇、血管病和神經內科綜合疾病診療;神經影像科是神經放射診斷。與此同時，醫院還設立了凈化手術間8間，其中百級手術室2間，以神經外科為龍頭，并開設神經內科、神經康復等相關科室，集治療、康復、預防、科研、教學為一體。

　　作為云南首家神經外科領域高端的三級專科醫院，昆明三博腦科目前正在配置全面信息化體系，建設包括HIS、LIS、PACS、電子病歷、手術麻醉、手術視教等系統為一體，支持遠程會診、遠程辦公、涵蓋病人信息、藥品信息、診療信息、費用信息的現代化、數字化醫院，這些信息系統可與云南省、昆明市醫保系統進行對接，并可建立和長期保存患者健康檔案。