奇臺縣中醫院的發展幾經變遷，解放初期，由縣城的幾家藥店成立了公私合營中西醫藥店，在文革期間進行社會主義醫療制度改革，于1970年7月與西北灣公社衛生院合并，文革后期(1975年)又恢復為奇臺鎮醫院，1986年成立了奇臺縣中醫醫院。

奇臺縣中醫醫院經過20余年的發展已具有相當規模，從占地面積100多平方米的幾間土平房發展到今天全院總占地面積4800多平方米和二棟總建筑面積達7000平方米的樓房；職工人數由20年前的二十幾人增加到現在的115人；醫療器械從20年前的聽診器、血壓計和干針、艾條發展到今天由電腦控制的全自動生化分析儀、全自動血流變分析儀、全自動血球分析儀、心臟起搏除顫儀、500毫安電視系統X光機、心腹多功能彩色B超機、心電圖等先進的醫療設備，是一所集預防、保健、康復及教學科研為一體的地域性中醫醫院，醫院開設有內科、兒科、外科、口腔科、婦科、皮膚科、預防保健科和心腦血管、糖尿病專科及化驗室、B超室、心電圖室、X光室等輔助科室。近年來，醫院以中醫特色為辦院方針，努力把醫院辦成“院有重點、科有特色、人有專長”的等級醫院,在不斷提高職工整體素質、醫療質量、技術水平的同時，堅持“以病人為中心、以滿意為目標”的服務宗旨，再結合本院實際情況和患者的需求，不斷開拓創新，引進了區內外先進的診療技術和醫療設備，并在原有科室的基礎上又開設了具有中醫特色的針灸推拿科和肛腸科，利用中西醫結合的方法，從多方位患者提供了就診機會，醫院始終堅持以較低的費用的為患者提供質量較高的醫療服務為辦院宗旨，特別是2006年醫院門診人次達到了9萬多人，出院人次2000人，并取得了良好的社會效益，深受各族群眾好評。

近年來，奇臺縣中醫院始終堅持全心全意為人民服務的宗旨，以質量求生存，以改革求發展，突出中醫專病專科特色，堅持走科技興院、科技強院的發展之路。把造就和培養一批德、才兼備跨世紀醫療骨干作為重點工程來抓，塑造優質文明的醫院形象。為使醫院走向良性發展的道路特向社會公開承諾：不收受紅包、不接受病人吃請、不推諉病人；合理檢查、合理用藥、合理收費。

醫院今后五年的總體發展目標：5年內基本建成規模適度、功能完善、在昌吉州東部地區規模**、技術**、設備**的二級甲等中醫醫院。奇臺縣中醫院所獲榮譽奇臺縣中醫院