烏魯木齊市中醫醫院成立于1960年，經過幾代中醫人的努力，醫院由小變大、由弱變強，現已發展成為集醫療、科研、教學、預防、保健、康復于一體的國家三級乙等中醫醫院，是新疆醫科大學教學醫院、烏魯木齊地區中醫適宜技術培訓基地及自治區醫保、兵團醫保、兵團農十二師醫保、鐵路醫保、烏魯木齊市醫保和所有商業保險定點醫療機構，一直保持“自治區級文明單位”的稱號，連續多年獲得醫保、商保的先進集體。

烏魯木齊市中醫醫院設總院和兩個分院，總院（紅山醫院），分院（南門醫院）（小十字醫院）。南門分院位于解放南路金融一條街，小十字分院位于解放北路商業中心；總院和分院地理位置的絕對優勢為醫院的服務網絡奠定了基礎。

　　烏魯木齊市中醫醫院現有職員536人，專業技術人員占85%，副主任醫師以上專家90人，開放一床位420張，年門診量51萬人次，年住院人數8000人。醫院擁有CR、CT、腹腔鏡、全自動生化分析儀、彩色多普勒、腫瘤微波治療等先進檢查設備。擁有全市最完備的制劑中心和康復輔助治療室；到位的配套后勤保障服務系統，管理制度建全。

　　烏魯木齊市中醫醫院堅持“以病人為中心，以質量為核心”，“以提高療效為重點，以兩個效益為目標”的辦院方針，加大改革力度，更新觀念，重視引進、培養人才，狠抓服務質量，始終把“揚中醫之長、納西醫之優、仁智存心中，誠信求發展”的服務理念貫穿于醫療服務的全過程，贏得了患者的贊譽。

　　糖尿病專科是全國重點專科，心腦血管病專科、肛腸病專科是自治區級重點專科，同時開展了中醫藥對老年性疾病、精神病疾病、亞健康狀態、養生康復的臨床研究和治療。

　　烏魯木齊市中醫醫院1996年被評為“國家三級乙等中醫醫院”、1995年被烏魯木齊市人民政府授予“科教興市先進集體”、2000年被授權為“新疆醫科大學教學醫院”、2003年被中央烏市委員會、烏市人民政府、烏市警備區共同授予愛國擁民模范單位稱號，2004年被評為自治區級文明單位，2003年、2004年、2007年被評為烏魯木齊市衛生系統綜合目標考核優秀單位。

　　烏魯木齊市中醫醫院是區級醫保、市級醫保、兵團醫保、鐵路醫保、兵團工一師、兵團農十二師、城鎮居民醫保、市（縣）新農合等多家醫保定點醫療機構；市級醫保的工傷、生育保險定點醫療機構；烏魯木齊地區所有商業保險公司定點醫療機構；自治區級醫保信用支付單位；市級、兵團農十二師醫保慢病審批指定醫療機構。