自治區人民醫院分院（原新疆交通醫院）始建于1984年，是一所集醫療、教學、科研、預防、康復、社區衛生服務于一體的二級甲等綜合型醫院。2005年10月自治區人民政府批復交通醫院整體移交自治區人民醫院并確定為自治區人民醫院分院，是自治區、烏魯木齊市、商業保險的“定點醫療機構”，自治區高速公路、市120急救的院前急救站，“烏魯木齊骨科醫院”，北京積水潭醫院“骨科協作中心”。

分院隸屬新疆維吾爾自治區人民醫院領導，現占地面積2.8萬平方米，建筑面積3.3平方米。分院目前有19個臨床科室，6個醫技科室，13個行政職能科室，3個中心（體檢中心、社區服務中心、社區離退休服務中心）。職工總數500余名，編制床位160張，對外開放床位350張。年門診診療6萬余人次，年出院病人5千余人次，年手術3千余例。

分院擁有大型CT、C型臂血管機、CR、DR、高壓氧倉、體外碎石機、電子胃鏡、電子腸鏡、氬氣刀、全自動大生化、西門子彩超、等大型醫療設備，為廣大的患者創造了良好的就醫條件。分院的心臟中心，心內科、骨科，泌尿科，消化科，婦產科、口腔科，體檢中心等均成為分院的專科特色，對各種心臟疾病和骨科疾病的治療居于全疆同級醫院**水平。心臟中心能獨立開展法樂氏四聯癥、心內膜墊缺損、單雙瓣置換、三尖瓣下移畸形、搭橋、房、室間隔缺損、介入、單項起搏器、房缺、封堵，等重大手術。

分院能單獨開展高難度人工髖、膝關節置換術、人工關節翻修術、骨腫瘤切除術、消化危重癥搶救、疑難消化疾病的診治、膽胰管結石的內鏡下碎石及十二指腸乳頭括約肌切開取石術，內鏡下鼻膽引流術、膽胰管狹窄擴張支架置入術、消化介入等方面的高新尖診斷治療技術、腹腔鏡全膀胱切除術、腎部分切除術、腹腔鏡下前列腺癌根治術、胸腺切除術、宮腔鏡結合腹腔鏡聯合手術、治療動脈瘤等疾病，其中一些手術已填補了醫院、自治區乃至西北地區的空白，為醫院實現“大專科、小綜合”和可持續發展奠定了良好的基礎。

分院在自治區人民醫院的統一的管理下，分院領導班子團結奮進、開拓進取、以人為本，以科學發展觀帶動分院全面發展，推出了“一日清單制”“二級醫院收費三級醫院醫療”“三餐免費”“便民大藥房”“預約掛號”“社區服務”等多項便民舉措，為廣大的患者提供了較好的醫療服務。