南昌大學附屬眼科醫院創建于2011年1月，于2012年5月12日正式運行，位于南昌市八一大道463號，是目前江西省唯一一所集醫療、教學、科研、預防為一體的省直三級公立非營利性專科眼科醫院，是江西省城鎮職工（居民）基本醫療保險定點醫療機構、江西省新型農村合作醫療省級定點醫院、異地就醫定點醫療機構和南昌市城鎮基本醫療保險定點醫療機構。江西省眼科學與視覺科學研究所、南昌大學眼科研究所、南昌大學眼科學與視光學系、南昌大學附屬眼科醫院眼科研究所先后在醫院掛牌，同時又是南昌大學本科、碩士、博士點培養單位。
　　醫院開放床位120張，建筑面積10080平方米，設有眼眶病、角膜病、青光眼、眼底病、兒童眼科、白內障、斜視弱視、屈光手術、視網膜遺傳眼病、中醫眼科、眼外傷科、淚器病科、神經眼科、眼整形科、低視力及視覺康復共15個臨床專科，另有眼功能檢查、檢驗、病理檢查3個醫技科室。是江西省第一個設備先進、技術成熟、基礎研究與臨床應用緊密結合的眼科領域研究開發平臺，配備層流細胞培養室、病理室、分子生物學實驗室、電生理實驗室、眼科顯微手術操作室、基因遺傳等6個研究室，眼視光學實驗室、眼科學實驗室、定配實驗室、顯微眼科實驗室等4個本科教學實驗室，建成2個同步視頻傳輸示教室。
　　醫院現有職工92人，其中技術職稱人數88人。高級職稱10人，博士4人，碩士25人，獲國務院政府特殊津貼專家1名，博士生導師3人，碩士生導師5人，兼職教授4名，有來自海內外知名教授溫榮、馬建興、宮海燕、黃波、劉樂元、甘霖、楊正林等客座教授6名，入選贛江學者1名。另，聘任中國醫師協會眼科分會副主任委員、中華醫學會眼科分會候任主任委員王寧利和教育部“新世紀優秀創新人才計劃”專家、長江學者特聘教授、中華眼科學會角膜病學組委員劉祖國為南昌大學附屬眼科醫院名譽院長。
　　醫院整體規劃本著人性化設計理念，風格高雅清新，設備先進精良，各項服務設施一應俱全，能夠充分滿足眼科病患的各項需求。
　　醫院秉承“明眸明德、仁心仁術”的院訓要求，始終踐行“公立公益、服務光明”的辦院宗旨，潛心為解決眼病疑難雜癥，培養專業人才，研究和預防眼病方面做出積極貢獻。眼科醫院的組建填補了江西省沒有公立眼科專科醫院的空白，促進了江西省眼科醫療診治及眼科學教育教學科研水平的提升與發展，受到了來自社會各界的一致好評。
　　南昌大學附屬眼科醫院2014年通過了CFDA的國家藥物臨床試驗機構資格認定，認定專業為眼科，可以承擔眼科相關的藥物及醫療器械的臨床試驗工作。