醫院始建于1952年，由一個總部、三個社區衛生服務中心和二十一個社區衛生服務站組成，是一家集基本醫療、社區衛生服務和公共衛生服務為一體的二級醫院，是唯一具有三級垂直醫療服務模式的區屬醫療單位，網絡內實行“五統一”工作機制。為杭州市中醫院臨平分院，浙江大學醫學院附屬口腔醫院協作醫院。醫院位于老城區，占地面積26畝，醫療用房3.3萬平方米，首期開放床位250張。醫院現有職工808人，其中在編職工621人，高級職稱49人，中級職稱127人。2014年總服務人次172萬。

　　醫院為全國院務公開示范點、浙江省文明單位、浙江省平安醫院、浙江省綠色醫院、浙江省健康促進醫院、浙江省全科醫學社區培訓基地、浙江省五星級規范化預防接種中心、杭州市健康單位，杭州市綠色醫院，杭州市青年志愿者服務標兵單位，杭州市文明單位，余杭區人才培訓基地、余杭區臨平口腔專科醫院。擁有螺旋CT、DR、口腔CT、胃腸機、C臂機、彩超、全自動生化分析儀、血凝儀、化學發光儀、胃鏡、腸鏡等高端醫療設備150余件。

　　醫院堅持大專科、小綜合發展定位，消化內科（脾胃病）、口腔科、內分泌科、骨傷科、普外科、神經內科、腫瘤內科、皮膚科、全科醫療科、針灸疳積科為院級重點學科，其中中醫脾胃病通過杭州市重點專科（專病）建設項目驗收，內分泌科為余杭區名科，口腔科和消化內科為區級重點學科。